Une clinique, c'est trois métiers dans un même bâtiment. Votre comptabilité doit le savoir.

Des soins exonérés de TVA, une pharmacie commerciale avec du stock, et des médecins qui peuvent relever de trois statuts différents. Chacune de ces trois zones a ses propres règles — et c'est leur frontière, jamais leur contenu, qui produit les redressements.

« Les cliniques sont au réel » — c'est un raccourci

On lit partout que les cliniques privées relèvent obligatoirement du régime du réel. Ce n'est pas ce que dit le texte. L'article C 39 du CGI définit le champ de l'Impôt Général Synthétique par le chiffre d'affaires, avec deux seuils distincts :

La conséquence pratique diffère selon votre forme. Un cabinet médical individuel reste sous l'IGS tant qu'il n'atteint pas 30 millions — il n'est pas au réel par nature. Une clinique dotée d'un plateau technique, avec hospitalisation, laboratoire, imagerie et pharmacie, franchit ces seuils dès ses premiers exercices : elle bascule au réel, et là seulement l'affirmation devient vraie. Le dépassement en cours d'exercice entraîne un reclassement d'office — ce n'est pas une option que l'on exerce, c'est une conséquence que l'on subit.

Trois activités, trois logiques comptables

Le ministère des Finances est explicite sur le périmètre exonéré de TVA : « les examens, consultations, soins, hospitalisation, travaux d'analyse et de biologie médicale et les fournitures de prothèses effectuées dans les formations sanitaires ». Tout ce qui n'est pas dans cette liste suit le droit commun — et c'est là que se situe votre pharmacie.

La TVA de votre échographe ne reviendra jamais

C'est la contrepartie que l'exonération ne dit pas. Être exonéré de TVA sur les soins signifie que vous n'en collectez pas — mais aussi que vous ne récupérez pas celle que vous payez pour exercer cette activité. Sur un plateau technique, la note est lourde :

Ces 4,62 millions ne sont pas une créance sur l'État : ils s'incorporent au coût d'acquisition et s'amortissent avec la machine. Toute décision d'investissement dans une clinique doit donc se raisonner en TTC — un devis comparé hors taxes vous trompe de près de 20 %.

Mais votre pharmacie, elle, est une activité taxable. Vous êtes donc un assujetti partiel, et trois cas doivent être distingués :

Les tiers payants : soigner aujourd'hui, être payé dans trois mois

Une clinique conventionnée délivre les soins immédiatement et se fait régler par l'assureur ou l'employeur bien plus tard — souvent 60 à 90 jours, parfois davantage. Entre-temps, elle a payé les salaires, les consommables et l'électricité. C'est la première cause de tension de trésorerie du secteur, et elle est invisible dans un suivi de caisse : votre compte en banque baisse alors que votre activité progresse.

Trois façons de payer un médecin — dont une qui n'en est pas une

C'est le poste le plus lourd et le plus mal sécurisé. Le même praticien, pour le même travail, peut être rémunéré de trois manières aux conséquences radicalement différentes :

Quel que soit le montage retenu, deux réflexes : exigez le NIU de tout praticien non salarié et de chaque fournisseur — une facture émise par un contribuable inconnu de la DGI fragilise la déductibilité de la charge, et notre outil de vérification de NIU tranche en quelques secondes ; et appliquez les bonnes retenues sur les honoraires, les loyers et les prestataires — le détail des taux est dans notre guide des retenues à la source. Sur les niveaux de rémunération pratiqués : le salaire d'un médecin au Cameroun.

Ce qu'il reste à mettre en place

Les obligations de forme sont communes à toute entreprise en zone OHADA : livre-journal, grand-livre, balance générale et livre d'inventaire, tenue en partie double, pièces justificatives datées et classées, corrections par inscription en négatif et jamais par rature. Nous les avons détaillées, textes à l'appui, dans notre article sur la comptabilité d'une école privée — les mêmes règles s'appliquent ici, avec un exercice qui coïncide obligatoirement avec l'année civile.

Ce qui vous est propre, c'est ce que vous venez de lire : la frontière soins / pharmacie / annexes, le prorata de TVA, les créances sur tiers payants et le statut des praticiens. Une clinique qui tient ces quatre points tient sa comptabilité. Bonne nouvelle au passage : si un centre des impôts vous réclame la patente, vous ne la devez pas — la lettre-circulaire n° 014 du 23 mars 2026 le dit noir sur blanc.

Sources. Code Général des Impôts camerounais, article C 39 (champ de l'IGS : seuil de 50 millions pour les activités commerciales, industrielles, artisanales et agropastorales, 30 millions pour les professions libérales) et liste des produits exonérés annexée au Code. Ministère des Finances, exonérations à caractère social : périmètre exonéré de TVA cité mot pour mot. Lettre-circulaire n° 014/DGI/DLRI/L du 23 mars 2026 sur l'exemption de patente des écoles et structures de santé. Acte uniforme OHADA relatif au droit comptable et à l'information financière pour les obligations de tenue. Les chiffrages présentés — échographe à 24 millions, clinique à 120 millions de chiffre d'affaires dont 30 de pharmacie — sont des exemples pédagogiques construits par LeFisk pour illustrer des mécanismes ; ils ne décrivent aucune structure réelle. Le taux de TVA retenu est de 19,25 %. Le prorata applicable, le classement TVA de chaque référence pharmaceutique et le statut de vos praticiens dépendent de votre situation : cet article expose une méthode, il ne remplace pas l'examen de votre dossier.